Layanan Penelitian Metagenomik di Bioinformatics Core Facilities IMERI

1. Layanan Ekstraksi DNA
   Menerima berbagai jenis sampel seperti feses, saliva, swab, jaringan, dan sampel metagenomik lainnya. Turnaround time 1-2 minggu untuk 48 sampel.
2. Layanan Sequencing Menggunakan Illumina MiSeq
   Melaksanakan proses library sequencing sesuai dengan protokol 16s rRNA metagenomic Illumina. Turnaround time 2-3 minggu untuk < 96 sampel.
3. Layanan Analisis Bioinformatika
   Laporan quality control:
   a.  Kualitas per basa dalam Q-score
   b.  Kualitas per read sequence dalam Q-score

Laporan hasil analisis:
a.  Analisis taksa lengkap mulai dari domain sampai ke genus (80-90%) dan spesies (10-60%)
b.  Analisis alpha diversity (shannon, chao1, simpson e)
c.  Analisis beta diversity (weighted, unweighted, bray curtis, jaccard)
d.  Analisis statistik korelasi dengan variable klinis (spearman)
e.  Analisis statistik dasar untuk melihat perbedaan signifikan antar kelompok (Kruskal-Wallis, PERMANOVA)

Turnaround time 2 minggu. Menyediakan pendampingan khusus untuk interpretasi hasil bersama tim bioinformatika.

Untuk informasi lebih lanjut, hubungi via WhatsApp +62 812 1655 2822